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胰腺癌多模态精准分型与智能辅助决策系统的研发项目
询价(谈判、磋商)公告
一、项目基本情况项目编号(院内编号):****点击查看
项目名称: 胰腺癌多模态精准分型与智能辅助决策系统的研发
采购方式:□谈判□磋商√询价
预算金额: 29万元 拟采购数量:1
最高限价: 29万元
采购需求:
(一) 技术要求
1.服务范围
1.1在测试样本的筛选、运输和保存等方面作出指导。
1.2检测内容
1.2.1人源DIA相对定量检测:采用最新一代高通量质谱Orbitrap Astral,配备Asymmetric Track Lossless非对称轨道无损质量分析器,能够以高灵敏度和高达200HZ的扫描速度采集高动态范围HRAM谱图,单个样本24min检测时长,实现蛋白质组超深度鉴定的全息扫描蛋白质组学检测。
1.2.2 组学检测:包括DIA分析。质谱实验分析流程主要包括蛋白质提取、肽段酶解、色谱分级、液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)数据采集、数据库检索等步骤;正式实验阶段主要包括DIA分析,质控分析,定性定量结果分析及生物信息学分析。下机数据采用DIA-NN搜库软件进行定性定量分析,提供蛋白定性定量列表,肽段定性定量列表,GO, KEGG ,Reactome, WikiPathways, GSEA, 转录因子, 激酶分析,互作网络分析和表型与组学关联分析等生物信息学分析结果。
1.3 检测数量:480例人源细胞和组织样本
2.平台要求
2.1 DIA组学相对定量检测:
1) DIA样本检测:分别掺入适量iRT标准肽段,每个样品进行1次DIA质谱测试。 每个样本时长24min。
2.2具备目前通用的DIA数据分析软件,DIA-NN搜库软件
2.3 供应商须同时具备完备的蛋白质代谢研究、DIA蛋白组检测分析及高端生物信息学分析服务能力,并提供证明材料:
2.3.1 蛋白质研究方向具备顶尖科研实力,近三年发表过Cell级别高水平研究论文,至少1篇署名文章。
2.3.2 拥有成熟稳定的DIA蛋白组技术体系,项目团队自主发表或协助甲方完成的DIA蛋白组相关SCI论文,至少发布2篇影响因子10分及以上的DIA蛋白组高水平论文。
2.3.3 具备高端、系统化生物信息学分析能力,至少发表过1篇影响因子≥10分的署名生信学术论文。
2.4 具备交互式交付,云平台交付能力。并提供证明资料。
2.5 服务供应商应具备蛋白组学仪器平台:质谱仪和超高压液相色谱仪,供应商需提交完整设备投入清单。(设备需提供设备清单及采购合同等证明材料)。
2.6 服务供应商应具备单个项目为500例及以上的队列研究的蛋白组学经验。并提供合同(如合同关键页,即合同首页、合同数量页及双方签字盖章页)。
2.7 具备Vanquish Neo UHPLC纳升液相系统,具备高通量样本检测能力,并提供资料。
2.8 拥有蛋白质组学自动化前处理设备(提供采购合同等证明材料)
3.检测要求
3.1 数据采集:
(1)检测模式:DIA采集模式下模式,母离子在质荷比(m/z)范围为 380 - 980 内进行扫描,在 m/z 为 200 时一级质谱(MS1)分辨率为 240000,归一化自动增益控制(AGC)目标为 500%,最大注入时间(IT)为 5 毫秒。在二级质谱(MS2)扫描的 DIA 模式中设置了 299 个扫描窗口,隔离窗口为 2 m/z,高能碰撞解离(HCD)碰撞能量为 25 电子伏特(eV),归一化 AGC 目标为 500%,最大注入时间为 3 毫秒。
(2)采用DIA-NN软件进行肽段及蛋白组匹配,过滤标准为: peptide FDR <0.01, protein FDR <0.01
3.2数据质控:
1) DIA 队列项目QC与样本质控:同时具备QC 样本, IRT 标准品,及293T 细胞 等多维度标准质控体系。
2) ****点击查看大队列质量控制体系,质控标准同时满足以下4项:
QC样本PCA图分布聚集效果良好;
QC样品CV中值小于20%;
QC样本间的相关性达到0.9以上;
主要的iRT均被检测到,并且保留时间整体较稳定;
4.1 DIA结果:
(1)蛋白鉴定与定量分析,对下机原始数据进行数据库检索,统计谱图数肽段数和蛋白数鉴定数量。蛋白、肽段鉴定列表。
(2)蛋白差异表达分析 差异表达蛋白筛选汇总,差异蛋白火山图,差异 蛋白聚类分析,蛋白表达趋势聚类(Mfuzzy)分析。
(3)功能分析:结构域分析,GO 分析,KEGG 分析,GO,KEGG ,Reactome,WikiPathways,GSEA,转录因子,激酶分析,互作网络分析和表型与组学关联分析。
5.项目周期:
5.1 质检合格后样本检测周期≤55个工作日;
5.2 数据分析≤10个工作日。
6.售后服务:
6.1 数据验收合格后,至少提供2年内的售后服务;
6.2 提供技术培训及咨询服务;
6.3 按甲方所撰写文章拟投杂志的要求提供分辨率和大小合格的图表;
6.4 免费进行一次组学分析培训;
6.5 能7*24小时处理甲方问题,**范围内有相应的销售与技术,免费进行疑难问题解答,对数据分析结果进行指导,并通过上门、往来信函、电话、传真、电子邮件,解答用户在使用中碰到的各种技术问题。
6.6 获取或知悉的任何可被合理认为具有保密性的信息,包括但不限于技术资料、研究报告、产品信息等,均需予以严格保密,不得向第三方披露。
本次采购不接受联合体投标。
二、申请人的资格要求:1.满足《****点击查看政府采购法》第二十二条规定;
2.落实政府采购政策需满足的资格要求:无
3.本项目的特定资格要求:无
注:单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商,不得同时参加本项目采购活动。参与本次采购活动的供应商之间有上述关系的,应主动声明,否则将给予列入不良记录名单、3年内不得参加本单位组织的采购活动的处罚。报价单位近三年内在经营活动中没有违法记录;报价单位未被“信用中国”网站(www.****点击查看.cn)列入失信被执行人名单、重大税收违法案件当事人名单,且未被“中国政府采购网”(www.****点击查看.cn****点击查看政府采购严重违法失信行为记录名单。
三、文件提交及截止截止时间: 2026年 10 月 13日 9 点 0 分(**时间)
文件提交形式:纸质提交至我院10号楼311招采办公室左老师处
地点:**市**区**路270号
时间: 另行通知
地点:**市**区**路270号
五、公告期限自本公告发布之日起3个工作日。
六、其他补充事宜无
七、凡对本次采购提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名 称: ****点击查看
地 址: **市**区**路270号
联系方式: ****点击查看5590
2.项目联系方式项目联系人:胰腺外科 肖老师
电 话: ****点击查看5590*胰腺外科