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为检测**市水松群体遗传多样性,揭示群体遗传结构及探讨水松濒危机制,对**市水松群体进行简化基因组测序,经研究决定,通过比选****点击查看公司。现将有关事项公告如下:
一、项目名称:**市水松简化基因组测序服务项目
二、项目控制价:3万元
三、服务期限:自签订合同之日起一年
四、项目委托内容及要求:
(一)检测我院提供的100个水松DNA样品检测指标如下:浓度:≥25 ng/μL,单样本总量≥1 μg;完整性:通过琼脂糖凝胶电泳检测,主带清晰,无明显降解。检测报告:需提供每个样品的浓度及完整性检测数据和胶图。
(二)对合格的DNA样品进行建库建库技术:需采用简化基因组测序技术(ddRAD-seq),可根据水松基因组特性选择合适的酶切方案,多种酶切组合可选择,具体如下:EcoRI + MseI、PstI + MseI、SbfI + MseI、SacI + MseI。文库类型:需为双端测序(PE),插入片段长度控制在300-500bp,合格的DNA样本保证建库成功。建库报告:中标方需提供文库质检报告,包括片段大小分布、浓度、Q-Sep400检测图。
(三)进行高通量测序测序平台:使用 Illumina NovaSeq 测序平台,测序策略PE150。测序量:10G raw data/样,总测序量为1000 Gb;测序数据过滤后 Q30 ≥ 85%,若单样本 Q30<80%中标方需免费重新测序;中标方需承诺提供测序数据的完整性以及真实性,确保数据合同期限内无丢失、无篡改。
(四)完成100个水松样品的生物信息学分析完成基础数据质控分析和标准分析。完成数据高级分析包括群体遗传多样性分析、PCA分析、群体遗传结构分析、系统发育树构建、组建SNP差异分析、系统发育网络、连锁不平衡分析、遗传图谱构建、QTL定位等。
五、付款方式:
完成100个水松样品的测序分析工作后,向我院提交全部数据和分析报告,验收合格后支付全部费用。比选文件发布时间、方式或事项,比选文件随同本比选公告一并发布,参选人应在****点击查看门户网站下载比选文件。
下载比选文件开始时间:2025年7月9日。
六、比选须知
(一)参选方需提供合格有效的营业执照。
(二)参加比选的单位应于2025年7月16日上午10:00前将比选文件,包含附件中的比选投标报价单(项目总报价,加盖公章)、授权委托书、委托代理人身份证复印件、法人营业执照(复印件需加盖公章)、公司资质证明文件等(复印件需加盖公章),送到****点击查看办公楼209室,收件人:吴先生,联系电话:0591-****点击查看1427,逾期将不予接受。
(三)中选方的确定:最低价中标。
(四)开选时间和地点:
开选时间:2025年7月16日上午10:30。
开选地点:****点击查看办公楼四楼会议室。
(五)中选结果公示:开选结束,中选结果在****点击查看门户网站公布,公示期1个工作日。
(六)项目招选方:****点击查看,联系地址:****点击查看区新店上赤桥35号。
联系人:吴先生 联系电话:0591-****点击查看1427 门户网址:http://www.****点击查看.org
****点击查看 2025年7月9日