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（单细胞转录组测序（scRNA-seq））委托外送检测
公开招标文件
| 项目编号： | ****点击查看 | ||
| 编制日期： | 2025年9月 26 日 | ||
招标公告
一、项目基本情况
****点击查看医院拟开展一项关于痛风病人的基础研究，送检12个病人血样，进行scRNA+scATAC监测，委托外送检测。
二、单细胞转录组测序（scRNA-seq）技术参数要求：
1. 单细胞转录组样本处理
（1）使用GEXSCOPER组织解离液进行组织解离得到细胞悬液。
（2）使用Countstar荧光细胞计数仪结合显微镜对细胞悬液进行质检；采用荧光技术原理同时检测采购方样品的细胞悬液浓度、细胞活性、结团率，细胞直径分布，有无红细胞污染等重要指标，样本要满足建库要求。
2. 单细胞转录组文库构建
（1）具备Singleron Matrix NEOR文库构建系统，基于微流控微孔板技术原理完成细胞分离，使用GEXSCOPER Single Cell RNA Library Kit 单细胞转录组试剂盒完成建库。
（3）采用安捷伦核酸片段分析仪(5300)对样本cDNA和构建好的文库进行文库质量检测，对符合标准的文库进行后续的上机测序。对符合合格标准（活性≥85%，细胞浓度≥1*105/ml）的样本，目标捕获细胞数不低于7000/样本。
3. 单细胞转录组数据产出
（1）要求使用Illumina Novaseq测序平台进行测序，测序策略为PE150。
（2）测序质量要求：Q20＞85%，Q30＞80%，碱基类型分布均匀；采用严格的数据指控标准，保证数据质量。平均每个转录组文库测序数据量不低于100G。
4. 单细胞转录组结题报告展示
数据下机后，对测序数据进行质量评估，并出相应的质控结题报告来展示项目的有效数据量、测序质量、捕获细胞数、中值基因数等全面的数据产量及质量信息。
5. 数据保存时限
在项目完结交付原始数据后，可保存原始数据30天。
6. 售后服务团队安排及响应时间要求
投标方需为本项目配备足够的售后服务团队，在项目完结的6个月内，如采购方有需求，可向采购方提供免费的结题报告内的项目咨询以及技术支持服务。
投标方售后服务响应时间：电话响应时间要求6小时内，如遇电话无法解决的问题，可提供上门技术支持服务，到场响应时间要求3个工作日内。
单细胞染色质可及性测序（scATAC-seq）技术参数要求：
1. 单细胞染色质可及性测序样本处理
（1）新鲜样品保存及运输：能够提供组织保存液保存样品，血液样本用EDTA抗凝管采集，保存温度为2-8℃，保存时长达到72小时。
（2）新鲜样本单细胞悬液制备：使用温和的组织解离液对样品进行组织解离，获得高质量单细胞悬液。血液样本分离PBMC。
（3）单细胞核悬液制备：通过细胞核分离液，根据实际情况调整使用量，保证细胞核分离高效，浓度≥3*10^5 Nucleus /mL，细胞核成团率低，染色后的细胞核明亮且不成团。
（4）在单细胞核悬液制备完成后，使用荧光染料对细胞核染色后，使用细胞计数仪及荧光显微镜对样本的单细胞核悬液进行质检，并且采用荧光技术原理同时检测样品的细胞核浓度，细胞核活性，成团率，细胞核直径分布，有无红细胞污染等重要指标以满足建库要求。
2. 单细胞染色质可及性测序文库构建
使用Singleron Single Cell ATAC Library Reagent Kit建库试剂盒，利用Tn5转座酶特性，将含有测序接头的序列引入到转座区域。然后捕获转座后的产物，从而构建单细胞ATAC文库。
3. 单细胞染色质可及性测序数据产出
对于质检合格的文库使用Illumina测序平台对单细胞ATAC文库进行高通量测序，测序策略采用PE150，测序数据量不少于80G/样本。
4. 单细胞染色质可及性测序结题报告展示
数据下机后，对测序数据进行质量评估，并出相应的质控结题报告来展示项目的有效数据量、测序质量、捕获细胞数等全面的数据产量及质量信息。
5. 数据保存时限
数据保存时限：在项目完结交付原始数据后，可保存原始数据30天。
6. 售后服务团队安排及响应时间要求
投标方需为本项目配备足够的售后服务团队，在项目完结的6个月内，如采购方有需求，可向采购方提供免费的结题报告内的项目咨询以及技术支持服务。
投标方售后服务响应时间：电话响应时间要求6小时内，如遇电话无法解决的问题，可提供上门技术支持服务，到场响应时间要求3个工作日内。
三、标书要求：标书制作一正一付如下：
3.1正本需加盖投标单位红章，并有授权代表签字。投标文件副本为正本（确保正本已完成签字、盖章等所有文件编制工作）的复印件；如正本副本装订完成后仍有修改的，正本、副本同时修改，并在修改处签字、盖章。
3.2投标文件页码顺序如下：
1、封面；2、报价一览表（竞标单位自制）；3、投标人营业执照、授权代表法人委托书（含身份证复印件）、本项目涉及的相关资质文件；4、投标技术参数响应情况；5、同类项目近一年的合同书（建议三份或以上）；6、其它需说明的资料。
3.3投标文件封面标明：
1、招标编号：
2、项目内容：
3、投标单位全称： 4、授权代表姓名\联系电话：
5、日期：
四、需准备现场PPT介绍，公司资质、同类项目开展情况、公司优势等。
五、潜在供应商有意向参与竞标，请予发送10月10 日前《报名表》填写后发至****点击查看@qq.com.。
六、本项目开标时间定于2025年10月14日上午8：10；
开标地点：**市**区横街路218****点击查看医院1号楼竞标室。
七、评标方法：采用综合评标方，****点击查看小组成员综合评价，独立推选中标排序。
八、不明事宜，请联系项目负责人：包老师（0576-****点击查看6788）
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